Institutionen för experimentell medicinsk vetenskap

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens 100 främsta lärosäten. Här finns 40 000 studenter och 7 400 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.

Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 2700 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.

Work tasks
Lund University Bioinformatics Infrastructure (LUBI) is a new university-wide infrastructure that develops and provides bioinformatic services for research groups at the university. We are seeking an applications expert for running the daily activites of the infrastructure. The position is administratively located at the Medical Faculty, however, the application expert will spend substantial part of the time at LUNARC, Center for Scientific and Technical Computing, where the software and hardward will be located.

Qualifications
Candidates should have a degree in computer science, bioinformatics, computational biology, or a related discipline. Knowledge about relevant areas in biology and medicine (next generation sequencing, molecular biology, biochemistry, genetics, etc. would be beneficial.

The successful candidate should have documented experience within the following areas:

- Administration of Linux/Unix-based system;

- building, installing and maintaining software from source;

- support and debugging;

- scientific programming, preferably on Python or Perl;

- statistical analysis and statistical programming, preferably in R

- excellent skills in oral presentation and good writing skills;

- good communication skills;

- independent work in projects together with researchers and research groups.

Experience on following areas will be considered as additional merits:

- Experience on bioinformatic data analysis and pipelines;

- knowledge of biomedical resources and infractructures;

- expertise in genomic data analysis;

- data structures, data bases and data architectures;

- knowledge in Singularity and Docker for software packaging;

- knowledge in HPC related services, such as SLURM, Torque, Maui, or PBS;

- knowledge in parallel file system technologies, such as SpectrumScale/GPFS, Lustre or GlusterFS;

- knowledge in HPC infrastructdure, such as Infiniband;

- experience on user training

The position is immediately open.

Salary is set after agreement.

Anställningsform Umowa o pracę na czas określony dłuższy niż 6 miesięcy
Anställningens omfattning Heltid
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100
Ort Lund
Län Skåne län
Land Sverige
Referensnummer PA2018/188
Kontakt
  • Mauno Vihinen, 046-2220000
Facklig företrädare
  • OFR/ST:Fackförbundet ST:s kansli, 046-222 93 62
  • SACO:Saco-s-rådet vid Lunds universitet, 046-222 93 64
  • SEKO: Seko Civil, 046-222 93 66
Publicerat 2018-02-05
Sista ansökningsdag 2018-02-19

Wróć do ofert pracy